Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa11P31311 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms