Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms