Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms