Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms