Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RxraP28700 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RxraP28700 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RxraP28700 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RxraP28700 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RxraP28700 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms