Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb3P28231 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms