Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms