Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms