Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U2af2P26369 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af2P26369 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms