Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgaP26339 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgaP26339 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms