Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms