Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnd1P25322 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms