Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk11bP24788 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms