Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms