Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms