Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsta3P23591 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsta3P23591 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms