Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms