Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja1P23242 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja1P23242 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gja1P23242 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms