Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3aP23116 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms