Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clk1P22518 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms