Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcb1aP21447 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms