Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim1P20664 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim1P20664 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms