Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TP20293 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TP20293 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TP20293 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TP20293 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TP20293 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TP20293 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TP20293 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TP20293 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TP20293 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TP20293 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms