Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms