Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VimP20152 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VimP20152 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VimP20152 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VimP20152 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VimP20152 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VimP20152 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VimP20152 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VimP20152 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VimP20152 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
VimP20152 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VimP20152 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VimP20152 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VimP20152 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VimP20152 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms