Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P20040 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P20040 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P20040 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P20040 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P20040 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P20040 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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