Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfaP20033 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms