Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms