Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnc1P19123 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnc1P19123 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnc1P19123 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnc1P19123 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnc1P19123 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnc1P19123 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnc1P19123 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnc1P19123 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms