Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18529 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18529 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P18529 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18529 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms