Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpraP18052 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpraP18052 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpraP18052 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpraP18052 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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