Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmga1P17095 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmga1P17095 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmga1P17095 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmga1P17095 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmga1P17095 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmga1P17095 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms