Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ass1P16460 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ass1P16460 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ass1P16460 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ass1P16460 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ass1P16460 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms