Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms