Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms