Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms