Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms