Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms