Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms