Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nid1P10493 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms