Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3cP0DOY1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms