Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms