Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms