Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LtaP09225 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LtaP09225 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LtaP09225 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtaP09225 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtaP09225 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtaP09225 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LtaP09225 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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