Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb1P09055 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb1P09055 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms