Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NefmP08553 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefmP08553 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NefmP08553 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefmP08553 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefmP08553 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefmP08553 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefmP08553 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefmP08553 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefmP08553 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefmP08553 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefmP08553 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefmP08553 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefmP08553 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefmP08553 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefmP08553 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefmP08553 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefmP08553 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefmP08553 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NefmP08553 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NefmP08553 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NefmP08553 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NefmP08553 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NefmP08553 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefmP08553 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefmP08553 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefmP08553 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefmP08553 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefmP08553 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefmP08553 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefmP08553 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefmP08553 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NefmP08553 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefmP08553 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefmP08553 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefmP08553 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefmP08553 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NefmP08553 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefmP08553 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefmP08553 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefmP08553 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefmP08553 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefmP08553 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms