Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms