Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms