Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgamP05555 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgamP05555 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms