Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a1P02463 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a1P02463 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a1P02463 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms